毛腿吸血蝠为毛腿吸血蝠下唯一一种，哺乳纲、翼手目、叶口蝠科的一属，而与毛腿吸血蝠属同科的动物有长腿蝠属（丽长腿蝠）、白翼吸血蝠属、吸血蝠属等数种哺乳动物。
界：动物界Animalia
门：脊索动物门 Chordata
纲：哺乳纲 Mammalia
目：翼手目 Chiroptera
科：叶口蝠科 Phyllostomidae
属：毛腿吸血蝠属 Diphylla
Spix, 1823
种：毛腿吸血蝠 D. ecaudata
二名法Diphylla ecaudata