学院设有深圳市重点建设的城市人居环境科学与技术实验室的地学基础、应用生态学和数字城市3个分室，深圳市循环经济重点实验室、北京大学—香港大学深港发展与创新研究中心、景观生态学与数字城市研究中心、中国城市设计研究中心、土地经济与房地产研究中心、生态修复与废物资源化技术研究中心及景观设计学系等科研和教学平台。同时，还设有具有独立法人资格的北京大学（深圳）国土与城市规划设计研究院。
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学院设有地理学（城市与区域规划）和地理学（景观设计学）两个硕士生招生专业，并依托北京大学城市与环境学院自然地理学和人文地理学两个博士点招收博士研究生。上述专业自2002年开始招收研究生以来，累计招收硕士研究生336人，博士研究生32人。目前学院全日制在校学生196人。
学院现有教员51人。包括常驻全职教员13人（其中教授8人、副教授2人、讲师3人）；北大本部任课教员15人（其中院士1人，教授6人，副教授8人）；外聘兼职教授14人，在站博士后研究人员9人。